Institut de Chimie & Biologie des Membranes & des Nano-objets • Bordeaux

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Yann Fichou, 3 May 2018, 2pm, IECB Internal CBMN seminars: A. Ciaccafa... Alain Roussel, 29/03/2018, 4 pm, EN... Simon Poly, 22 march 2018, 2pm, ENS... J.Crassous, M. Sallé & A. Martinez... O.Reinaud & V. Artero, 7/12/2017, 1... R. Dos santos Morais, 30/11/2017, 4... Christian Griesinger, November 24th... Takahiro Muraoka, 16/11/2017, 11am,... Vladimir Torbeev, 9/11/2017, 2pm, E... M. D. Smith & T.Constantieux, 3/11/... James Nowick, 15 september 2017, 11... Emmanuelle Thinon, 28 June 2017, 11... Caroline Tokarski, 15 June 2017, 4p... Christian Salesse, 8 June 2017, 4pm... Patrice Rey, 01 June 2017, 2h30 pm,... Christina Sizun, 18 May 2017, 4 pm,... Marisela Velez, 5 May 2017, 11am, I... Iqbal Choudhary, 27 April 2017, 4 p... Vincent Aucagne, 21 April 2017, 11 ... Sophie Zinn-Justin, 14 April 2017, ... Cécile Feuillie, 16 February 2017,... Félix M. Goñi, 8 december 2016, 4... Félix M. Goñi, 17 november 2016, ... Carl Creutz, 20 october 2016, 4 pm,... Diego Romero, 30 september 2016, 11... A. Ciaccafava, 8 september 2016, 14... A. Ramamoorthy, 16 June 2016, 16h,... Alexandre de Brevern, 2 june 2016, ... Isabelle Landrieu, 26 May, 16h, ENS... Frances Sepavoric, 12 May, 16h, ENS... Thomas Pradeu, 7 April 2016, 9h, EN... Françoise Argoul, 3 march 2016, 1... Corinne Loutelier-Bourhis, 16/12/20... Aristotelis XENAKIS, 3 december 201... Fabian Kiessling, 26 november 2015,... Michaël Molinari, 20 november 2015... Dipankar Das Sarma, 28 October 2015... Olivier Donard, 22 october 2015, 16... E. Morvan & A.Grelard, 17/12/2015, ... Christophe Cullin, 10 september 201... Brigitte Lindet, 18 June 2015, 16h,... Marion Decossas, 4 June 2015, 16h, ... Pascale Schellenberger, 21 Mai 2015... F. Leal-Calderon, 7 May 2015, 16h, ... Ibrahim Abdulhalim, 9 April 2015, 1... Manon Carré, 26 March 2015, 14h, ... C. Bure & JM Schmitter, 19 March 20... T. Ogata & H. Ihara, 17 March 2015,... Banafshe Larijani, 12 March 2015, 1...
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Soutenance de thèse de Laura Mauran, le 13 Décembre 2017, 14h à l'IECB



Laura Mauran soutiendra sa thèse, le mercredi 13 Décembre 2017, à 14h, à l'IECB, 2 rue Robert Escarpit, Pessac.

 

Foldamères stabilisateurs d’hélices peptidiques : Applications à l’inhibition d’interactions protéine-protéine

 

Résumé

 

Les α-hélices sont des éléments clés de la reconnaissance biomoléculaire, comme en témoigne le fait qu'une quantité significative de complexes protéine-protéine, dans la banque de données protéiques (PDB), présentent des interfaces inter-hélices. Cependant, de courtes hélices peptidiques isolées dans le but de bloquer ces interactions ne sont généralement que faiblement présentes en milieu aqueux et sont sensibles à la dégradation protéolytique, limitant ainsi leur potentiel thérapeutique. Diverses approches chimiques ont été proposées pour augmenter la propension au repliement en hélice des α-peptides. Une stratégie consiste à pré-organiser les premières liaisons amides à l'aide d'une « capping box » ou d'un substitut de liaison hydrogène. Récemment, nous nous sommes intéressés à la possibilité d'interfacer des peptides-α et des foldamères afin d’élaborer des « foldamères à blocs » générant ainsi un nouveau type d’architecture mime de l'hélice-α. Dans notre laboratoire, nous avons développé des foldamers à base d’urées qui s’organisent pour former des structures hélicoïdales. Les similitudes du sens d’enroulement, du pas et de la polarité entre l’hélice-α peptidique et l’hélice-2.5 d'oligourée suggéraient qu'il serait possible de combiner ces deux squelettes.

 

Au cours de cette thèse, nous avons montré que les chimères : oligourée/α-peptide, forment des structures hélicoïdales bien définies dans les solvants organiques polaires avec la propagation d'un réseau de liaisons hydrogène intramoléculaires continu couvrant la totalité de la séquence. Ces études ont suggéré que le squelette de l'oligourée qui possède une forte propension à adopter une structuration en hélice pourrait conduire au développement d’un « cap » permettant la pré-organisation des quatre premiers NHs ainsi que des quatre derniers groupements carbonyles d’une hélice-α peptidique. Nous avons donc étudié l'influence de courts fragments oligourées sur la stabilisation de séquences peptidiques modèles solubles dans l'eau en hélices-α, conduisant au développement de la « foldamer capping box ». Grâce à cette nouvelle stratégie de stabilisation des hélices peptidiques, nous avons pu concevoir des inhibiteurs de l’interaction protéine/protéine p53/MDM2.

 

 

 

 

Figure 1 : a) architectures d’un peptide structuré en hélice α et d’une oligourée structurée en hélice 2.5; b) peptides décorés d’une courte “foldamer capping box”.

 

 

Mots clés : foldamères, peptides, hélices, stabilisation, mimétisme, cancer

Encadrement : Dr Gilles Guichard

 

 

 

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